天启王朝全集中最后主角的结局和内容如下：
从历史上看，越是不懂得儒家学说和理仪的民族，就越是凶残彪捍，而越是学儒家学得多的民族则越是无能，满清入关时还不知儒学，可是等到他们学会了儒学之后，曾经的马背上最强捍的战士变成了可怜虫，清朝未期的八旗什么都不是，由此可以证明一件事，儒家学说你防得了君子防不了小人，你愚得了国人，但愚不了蛮族，当你把自己的国人变成只会磕头的可怜虫时，那些个不受儒家影响，保持着野蛮凶捍风格的蛮族侵入你的国家时，你的国民就只能被杀了。直到最后甚至有可能你中国人会奉蛮族为主，让异族人当*的皇帝。朱由校一直认为中国的衰落罪魁是封建主义，而祸首则是儒家和文人，他们结合在一起的力量加强了腐朽没落的封建权势，却在中国衰落的原因中起了很不光彩的作用。
当朱由校想到这里时又怎么不痛哭失声呢，他想我那可怜又可悲却又更加可恨的国家和民族啊，要我怎么去拯救你的灵魂啊！一时间朱由校在山头坐着哭得极为伤心。好半天朱由校才收起眼泪，转头看看身旁站着的都看傻了的王徵、宋应星、史可法、黄宗羲，然后用颤抖的手指着山下的平原村镇和远方的京城，问道：
“你们知道那是什么吗？”
众人愕然，不明所以，朱由校用愤然的声音说道：
“那不是京城，那是在黑暗笼罩下的一滩死水，死水就死水好了，不过只要朕在，就一定要将它掀起个冲天的巨浪。”
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第一百零四章，乱起
自从坐在山头想通了一切之后，朱由校感到自己从内心中往外的苍凉，他怎么也想不到真相竟是如此，他不是第一次感受到中国封建社会的强大了，中国的封建社会的结构是如此的完美和牢不可破，着实让他惊叹，事实上中国的封建社会是在外来侵略的基础上，受外来文化的冲击，这才渐渐处于崩溃的边缘，可是中国的封建社会的真正消亡却是在新中国成立之后才完成的，他不知道这对中国人来说是悲是喜。从自己分析出来的问题中，他感觉到，自己再也不能依靠着封建士大夫们和朝廷大臣们进行什么改革和进取了，这些传统的力量是顽固和不可改变的，万事还得靠自己才行，他想了，自己完全有可能把商会培养成为新兴的阶级，到时候依靠这个阶级的强大力量来颠覆这个时代，这样，中国才会有希望，自己莫名的来到了这个世界，总要做出点什么才行，他可决不愿意看着中国被满清占据，让后世的中国人再迎来百年的屈辱历史。
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