莲花生大师本生传的详细目录和章节如下：
第一章 西方极乐世界说
【14】空性 《佛学大辞典》载：真如之异名。真如是离开我法二执的实体，依空修空显示真如之实性，称为空性。请参看第5章注②。
第二章 无量光佛照化身
第三章 万千世界功德聚【1】
第四章 溯源金刚持灌顶【1】
第五章 凶邪茹札本生记
第六章 马面猪面胜茹札
第七章 灌顶一千零二佛
第八章 教法两种源流述
第九章 无尚佳族王子记
第十章两宗调伏具云国
第十一章 教制严明数印度
第十二章 话说乌仗亚那国
1.五百弓量 一俱卢舍，一弓，又称一寻、一庹，平伸两臂，两掌或两中指尖间的长度。请参看第7章注。①
第十三章 国王开仓济贫穷
第十五章 小记安札菩提王
第十六章 国王航海觅珍宝
第十七章 入宫途中解预兆
第十八章 国王祷告如意宝
第十九章 乌东哇拉宝莲花
第二十章 从政乌仗亚那国【1】
第二十一章 舍弃王位去远方
第二十二章 住居西南寒林坟
第二十三章 学习因缘历算法
第二十四章拜师求医方明
第二十五章 遍访诸师通五明
第二十六章 受灌持戒为僧侣
第二十七章 闻听修习法相乘【1】
第二十八章 向阿难陀问显宗
第二十九章 住在聚身坟墓里`
第三十章 住修欢乐遍及坟
第三十一章 在任运成就累坟
第三十二章 *楞伽累坟
第三十三章 莲花累坟行教化【1】
第三十四章 在大密幻术坟墓
第三十五章 遵观音旨居汉地
第三十六章 保护佛教设杨巧
第三十七章 灵鹫山顶观下界
第三十八章 公主找到小儿尸
第三十九章 曼达拉哇弃家行
第四十章 会见公主起风波
第四十一章 沙王火烧莲花生
第四十二章 在沙河尔却敌寇
2.七世丸 即第38章记叙的用七世婆罗门幼尸制作的肉丸
第四十三章 沙河尔国入佛门
第四十四章 获寿命自在持明
第四十五章 度阿育王【1】入佛门
第四十六章 白达等国传佛教
第四十七章 夺取孟加拉王位
第四十八章 拟调乌仗亚那国
第四十九章 传教乌钛亚那国
第五十章 吸引两国入佛门
第五十一章 调伏两洲外道者
第五十二章 龙遍入王被调伏
第五十三章 伏藏法和掘藏师
第五十四章 赤松德赞王吐蕃
第五十五章 王让臣民自主张
第五十六章 为桑耶寺寻寺址
第五十七章 菩提萨埵受邀请
第五十八章 菩提萨埵作预言
第五十九章 接见吐蕃王信使
第六十章 制伏吐蕃凶煞神
第六十一章 接见礼节意相左
第六十二章 建成宏伟桑耶寺
第六十三章 为桑耶请护法神
第六十四章 开光典礼桑耶寺
第六十五章 供养桑耶寺庙寺
第六十六章 请求二师永居留
第六十七章 赤松德赞订法律
第六十八章 慰王预告三译师
第六十九章 毗茹札那受邀请
第七十章 五位大德同译经
第七十一章 一百单八翻译家【1】
第七十二章 印度二十五学者【1】
第七十三章 毗茹札那在印度【1】
第七十四章 毗茹札那修快步【1】
第七十五章 弘讲佛法遭毁谤
第七十六章 毗茹札那唱道歌
第七十七章 在流放地传二宗
第七十八章 派五比丘赴印度
第七十九章 南夸宁苞遭流放
第八十章 邀请布马拉米札
第八十一章 大班智达显神通
第八十二章 迎请大德灭笨布【1】
第八十三章 毗茹札那回桑耶
第八十四章 在桑耶寺译佛经
第八十五章 整理佛经及论著
第八十七章 法相乘语论书目
第八十八章 内外密宗之译目
第八十九章 无常一切有为法
第九十章 预言公主白玛寒
第九十一章 在吐蕃国埋伏藏
第九十二章 伏藏发掘的时代
第九十三章 教诲幸遇伏藏者
第九十四章 分辨真假掘藏师
第九十五章 指点未来修行地
第九十六章 话说佛教之兴衰
第九十七章 想去西南罗刹国
第九十八章 牟德赞普作挽留
第九十九章 空行母赞莲花生
第一００章 敬仰大师之功德
第一０一章 徒弟们修行空乐
第一０二章 七世人肉和拉杰【1】
第一０三章 教导三位女弟子
第一０四章 调伏曜星和龙神
第一０五章 先遣人员到芒域
第一０六章 讲轮回罪和瑜伽
第一０七章 从吐蕃去罗刹国
第一０八章 书写信仰于白纸
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